综合信息部:

  协助中心领导处理日常工作，牵头制定中心内部有关规章制度和工作流程；承担中心信息化的建设和日常维护管理；承担采购、交易等重大事项的信息管理和发布及采购、交易活动的场地安排；协助专家库和诚信档案的建设及维护、使用；承担各类采购、交易情况的统计和分析上报；承担重要工作的协调督办和优质服务的考核工作；承担党务、纪检监察、人事、宣传、文秘、计生、保密、工青妇、保卫、政务公开、信访投诉、档案管理、后勤保障等日常工作。

 财务部:

  承担编制年度经费预决算计划、经费开支使用计划及申报；承担中心各项费用的统计、分析、年度财务报表决算汇总上报；承担采购交易服务费用的收取和保证金的收付管理工作；承担中心资金和服务项目的内部审计工作；负责（协调）中心窗口报名管理工作。

采购部:

  承担政府采购业务，组织实施区级政府集中采购目录中指定分类项目的采购，接受并代理异地委托的各类招标采购业务，按照相应的法规组织实施委托事项等工作；承担药品和医疗器械设备的集中招标采购工作；根据委托人拟定的采购需求书内容，依法编制采购文件，送交委托人审核、确认；组织项目评审；提供政府采购专业技术咨询服务；负责中介服务超市日常运作和接受涉密采购职责，定期汇总分析政府采购情况。

 建设工程交易部：

  承担建设工程交易业务，组织工程建设项目的开标、评标工作，为工程建设项目的交易提供全过程管理和见证服务工作；承担入场交易登记、进场确认书、中标通知书的办理工作；承担工程建设项目交易流程、操作规则等的草拟工作；承担工程建设项目交易资料、交易政策、市场信息的收集和整理并为当事人提供信息咨询服务；接受各类工程行业主管部门的业务指导；定期汇总分析工程建设项目交易情况。

土地及产权交易部 ：

  承担土地产权交易业务，承担土地使用权公开交易、产权交易、矿业权交易及政府资产交易等各类业务的受理和具体承办工作；对交易各方和中介机构进场交易资格的核验工作；收集和整理政策和市场信息，为交易双方提供信息咨询服务；负责土地使用权转让、出租、交易鉴证、税费测算等，为土地、矿业权、政府资产交易、洽谈、招商、展销和举办招标、拍卖会提供场所，为土地交易代理、地价评估、信息咨询等中介服务机构提供服务；负责定期汇总分析情况；接受有关行业主管部门的业务指导。